Histokimya, maddeleri hücre ve doku düzeyinde ayırt etmeye, yerleşimlerini ve miktarlarını saptamaya yarayan kimyasal tekniklerdir. Bu amaçla özel maddeler, reaktif gruplar ve enzimler kullanılabilir. Sık kullanılan histokimyasal boyalar;

• 1- PAS (Dokudaki glikojeni göstermek amacı ile)
• 2- Trikrom (Bağ dokusunu göstermek amacı ile)
• 3- Gümüş (Dokunun çatısını göstermek amacı ile)
• 4- Amiloid (amiloid birikimini göstermek amacı ile)
• 5- Demir (demir birikimini göstermek amacı ile)
• 6- vb. gibi.

Bu liste uzatılabilir. Patolojide şu anda aktif olarak kullanılan 35 kadar histokimyasal boya mevcuttur.